东吴证券前身为苏州证券公司，成立于1993年。同年8月3日正式对外营业。1997年苏州证券增资扩股，变更为苏州证券有限责任公司，注册资本金为1.04亿元。2002年，更名东吴证券有限责任公司，注册资本增至10亿元。2008年，改制为东吴证券股份有限公司，注册资本金为15亿元。

2011年12月，东吴证券股份有限公司在上海证券交易所挂牌上市，股票简称“东吴证券”，股票代码“601555”。